Если под «Linux» вы подразумеваете какую-то программу в Linux, при условии, что кодировка вашего эмулятора терминала установлена в UTF -8, а ваша локаль — это какая-то локаль UTF -8:
$ cat > utf8.txt <<<"This is 日本語。"
$ iconv -f UTF-8 -t UTF-16 utf8.txt > utf16.txt
$ head utf*.txt
==> utf16.txt <==
��This is �e,g��0
==> utf8.txt <==
This is 日本語。
$ iconv -f UTF-16 -t UTF-8 utf16.txt
This is 日本語。