KDE Plasma или KWin :файл конфигурации поврежден -как сбросить?

grepможет сделать за вас подсчет с помощью своего флага -c, поэтому wc -lне нужен. Кроме того, grepпринимает в качестве входных данных несколько файлов, если вы их предоставили.

Например,

grep -c '^>' some/dir/*.fa

Чтобы сделать это рекурсивно, используйте grep -Rc '^>' dirname, если у вас есть grep, который знает параметр -R, (это запустит все файлы ), в противном случае используйтеfind:

find dirname -type f \( -name '*.fa' -o -name '*.fasta' \) -exec grep -c '^>' /dev/null {} +

Дополнительный /dev/nullв приведенной выше команде гарантирует, что grepполучит по крайней мере два входных файла, что, в свою очередь, гарантирует, что он всегда будет отображать имя файла, который он обрабатывает (он не делает этого с один входной файл ). Можно также использовать -Hс grep, хотя это нестандартная опция -.

Или,с вашей исходной командой, подключенной к циклу, который получает пути изfind:

find dirname -type f \( -name '*.fa' -o -name '*.fasta' \) -exec sh -c '
    for pathname do
        printf "Counting in %s...\n" "$pathname"
        grep "^>" "$pathname" | wc -l
    done' sh {} +

Поскольку ваша команда сама по себе не сообщает имя файла, я добавил оператор printf, в котором оно упоминается.

Связанные:

• Описание параметра -exec команды `find`