relayd.conf не может загрузить сертификаты для реле https

Ваша попытка близка к фактическому решению. Соответствующий флаг можно найти в справке read:

$ help read
...
      -d delim  continue until the first character of DELIM is read, rather
            than newline

Это не упоминается явно, но вы можете установить разделитель пустым, и, таким образом, он будет читаться до EOF.

$ IFS=, read -d '' -a myarray < myfile

$ echo ${myarray[2]}
U2FsdGVkX1/c8rTTO41zVT7gB+KL+n7KoNCgM3vfchOyuvBngdXDGjXTvXTK0jz6