Невозможно использовать sudo при входе в систему с помощью PuTTY, но можно при использовании SSH из linux box

Проблема с вашей командой sed в том, что она слишком много совпадает. Давайте посмотрим на шаблон, а затем разберем его:

/01.00.*/

 01       # exact match (so far, so good)
  .      # any character (too generous)
    00    # exact match
     .*  # the rest of the line

То, что мы хотим сопоставить, это 01.00., за которым следует любое количество цифр и точек:

/01\.00\.[.0-9]*/

Обратите внимание, что мы используем \.для соответствия точкам вместо ., которое соответствует любому отдельному символу.