Вопросы Теги

сортировать, заменяя значения столбца на NA

Похоже, ваш /etc/apt/sources.listсильно испорчен. Вы каким-то образом оказались с репозиториями Xenial (16.04 ), включенными в вашей системе Trusty (14.04 ). Это, очевидно, вызывает странные конфликты пакетов, подобные этому.

Просто исправьте/очистите конфигурацию репозитория, запустите apt-get cleanи все должно снова начать работать.

1
14.04.2020, 23:12
1 ответ

См. комментарий αғsнιη. Я ожидал, что NA будут созданы по сортировке; однако они все время присутствовали в файле. 

> grep NA Coch_ATAC_peaks.bed
NA      2745    3143
NA      5650    6048
NA      9679    10077
NA      13412   13810
NA      39048   39446
NA      43021   43419
NA      55564   55962
NA      69578   69976
NA      110317  110715
NA      127371  127769

После того, как NA были удалены выше по течению > sort -k 1,1 Coch_ATAC_peaks.bedработает по назначению.

0
19.03.2021, 02:29

Теги

Похожие вопросы