Должен ли я открывать файлы в /home/user/ как пользователь root?

Если я правильно понял:

Предполагая, что все файлы имеют расширение TXT, вы можете

du -b *.txt | sort -n | tail -n1

и если вы хотите что-то более конкретное:

for a in *;do
    f=$( file -i $a | grep -Eo ": ([a-z\/]+);" )
    [ "$f" == ": text/plain;" ] && du -b $a
done | sort -n | tail -n 1