Скопируйте символьные ссылки от ext3 до доли cifs

Если экспортируемый диск CIFS смонтирован на Вашем поле Linux, нет никакой потребности использовать scp. Можно использовать 'CP-d исходное место назначения'. От man cp

-d     same as --no-dereference --preserve=links

--preserve[=ATTR_LIST]
       preserve the specified attributes (default: mode,ownership,time‐
       stamps),  if  possible  additional  attributes:  context, links,
       xattr, all

-P, --no-dereference
       never follow symbolic links in SOURCE

Я не уверен однако, если это значимо или возможно сохранить гибкие ссылки на NTFS и можно ли скопировать их назад. Если я вспоминаю правильно, что NTFS только имел своего рода жесткую ссылку, но это были довольно много лет, с тех пор как я посмотрел на это.

Если Вам не нужен доступ к файлам непосредственно (больше как резервное копирование), можно сохранить целое (файлы и ссылки) как файл tar.