Это должно помочь:
2018-06-25T08:13:11.458554Z 0 [ERROR] Fatal error: mysql.user table is damaged. Please run mysql_upgrade.
Пожалуйста, запустите mysql_upgrade
и после этого выполнитеservice mysqld start
Для работы печати паники _вам может понадобиться последовательная консоль, так как другая консоль может работать неправильно в контексте паники.