Если USB-оборудование вашего NAS поддерживает работу в режиме USB-клиента, вы можете использовать Linux -USB Gadget API Framework(или что-то на его основе ).
Я бы не рекомендовал хранить пароль в системном файле.
mysql -u root --database=yourdatabase -p < file.sql
Вам будет предложено ввести пароль, а затем выполнить команды SQL в файле.