Не удалось найти файл: не удалось загрузить ключ gpg для репо «mariadb-main»: ошибка Curl (37)

Это более или менее тот же тип ответов, что и некоторые, которые вы уже получили на подобные вопросы. :Сначала прочитайте один файл (позиции ), затем проанализируйте другие файлы и извлеките данные.

awk 'NR == FNR { pos[$1]=1; next } $2 in pos { f="desired_pos" $2; print >>f; close(f) }' positions NA*.bam_dp

Если в вопросе указаны два отдельных файла и если positionsвключает 142535975, то будет создан desired_pos142535975со следующим содержимым:

1   142535975   79 NA20507
1   142535975   135 NA20901

Это будет работать, если предположить, что все позиции относятся к хромосоме 1 (или, по крайней мере, к той же той же хромосоме, что и в отдельных файлах ), поскольку нет информации об имени хромосомы, кроме местоположения в файле positions.

4
11.09.2020, 10:03
0 ответов

Теги

Похожие вопросы