Клиент по-прежнему может войти в систему по ssh без пароля на сервере после создания новых ключей.

Вы можете использовать умную комбинацию подстановочных знаков, чтобы избежать .и..:

rm -fr.??*

будет одним из них, который работает, если у вас нет файлов или каталогов длиной всего 2 символа (, например .x, например ).

rm -fr.[!.]*

справляется с этой задачей лучше.