как выровнять дефис
Некоторые подробности о форматировании ваших данных будут полезны. Без каких-либо подробностей нам придется сделать некоторые предположения:
- SNP перечислены по одному в строке в каком-то файле
- ваши строки данных разделены пробелами -
- SNP, появляющийся в любом месте строки, считается совпадением в этой строке
- нам нужны столбцы 1, 2 и 3 из каждой совпадающей строки
В таком случае попробуйте это:
grep -f list_of_SNPs.txt very_large.txt | cut -f 1,2,3 > new_file.txt
2
david b.k
20.02.2020, 01:26
Ссылка
3 ответа
Похоже, вы хотите от nlдо выровнять по левому краю с шириной поля 3:
... | nl -nln -w3 -s '- '
или эквивалентная ширина поля 2, если вы хотите явно включить начальный пробел в строку разделителя:
.... | nl -nln -w2 -s ' - '
4
steeldriver
28.04.2021, 23:22
Ссылка
Вместо использования
… | nl -w1 -s ' - ' | …
для печати номеров строк, вместо этого вы можете использовать awkи отформатировать строку с помощьюprintf:
… | awk '{printf "%-2s - %s\n",NR,$0}' | …
2
Freddy
28.04.2021, 23:22
Ссылка
Первая идея, которая приходит на ум, это использовать (GNU)sedвот так:
sed -E 's/^([1-9]) -/\1 -/'
добавляется в конце ваших команд перед >>.
1
schrodigerscatcuriosity
28.04.2021, 23:22
Ссылка