Я предполагаю, что у вас есть только имена файлов. Это самый простой способ сделать это, я думаю:
while IFS= read -r file; do mv -v "dirA/$file" "dirB/$file"; done < listfile.txt
То же самое после чистой установки CentOS. Исправлено после запуска:
yum -y update
reboot