Хорошо, таким образом, ответ: по некоторым причинам, во время конфигурации, все элементы UI были на самом деле дублированы. Удаление дубликатов с dconf-редактором, кажется, фиксирует его. Благодаря don_crissti для указания на меня в правильном направлении!