Ext4 поврежден и не подлежит восстановлению после изменения размера LVM + сбоя питания

awk подход:

awk 'NR==FNR{a[$1]=$2;next}$2 in a{$2=a[$2]":"$3;$3=""}1' File_2 FS="[ |:]" File_1

Вывод:

522 Clostridium_tetani_E88:CTC00972     -   506 3.20E-138   
522 Natrialba_magadii:Nmag_3027    -   561 4.70E-73
522 nml:Namu_3564   -   566 1.80E-146

Обратите внимание, что коды nml и nla не совпадают между двумя входными файлами