в чем разница между монтированием через командную строку и с использованием графического интерфейса?

Думаю вряд ли разница действительно 100мб. Скорее всего, разница невелика, но происходит через границу округления, так что получается 3,8 ГБ в 3,7 ГБ. Например, это может быть разница между 3,76 и 3,74.

Кроме того, вполне разумно использовать 32-разрядную версию Linux в системе только с 4 ГБ оперативной памяти.