Коды ошибок Intel Wi-Fi

В bash (не простой sh) вы можете использовать шаблон**/подстановочных знаковдля рекурсивного обхода каталогов. Сначала вам нужно установить параметр globstar. Например, для запуска mycommandдля каждого файла .fastqв папке /project/samples:

#!/bin/bash
shopt -s globstar
for x in /project/samples/**/*.fastq; do
  mycommand "$x"
done

Это доступно только начиная с bash 4.0 (поэтому не на bash по умолчанию в OSX, но эта функция также доступна в zsh). Помните, что в версиях bash до 4.3 он также проходит по символическим ссылкам на каталоги.

Если вам нужно запустить одну команду для всех файлов, вы можете:

mycommand /project/samples/**/*.fastq

Однако вы можете столкнуться с ограничением длины командной строки. Это помогает использовать относительный путь:

cd /project/samples
mycommand **/*.fastq

Если это все еще не подходит, вам нужно найти другое решение, чтобы делать все, что вам нужно, которое не включает передачу всех имен файлов в качестве аргументов этой команде. сразу.