Доступ запрещен SSH из Windows в Linux через putty

Heredoc не выполняет повторную интерпретацию, или вы можно сказать, не запускает внутри никаких команд. Он просто интерполирует строки.

Итак, ответ на ваш вопрос состоит в том, что source -ing не будет происходить внутри heredoc.

Что касается последнего, вы можете использовать \ то есть обратную косую черту, чтобы ОТКЛЮЧИТЬ значение символов, которые вы не хотите расширять с помощью heredoc.