Я на самом деле сделал это на своем поле FreeBSD - так да, это возможно, но конечно необходимо заботиться для проверки этого sudo
работы правильно, прежде чем Вы сделаете так ;-)
sudo su
не будет больше работать, но можно все еще сделать sudo bash
получить корневую оболочку.
Во-первых, Wubi (который Вы, вероятно, подразумеваете под установкой Ubuntu "как Приложение Windows") на самом деле не устанавливает Linux как приложение; скорее это устанавливает Linux в образе диска, который живет в разделе Windows.
Вы могли пойти с виртуальной машиной с легким дистрибутивом (как Xubuntu), который должен обеспечить хорошую производительность в любой недавней машине.
Вы были бы более обеспечены для установки VirtualBox (или VMware Player, и т.д.) - производительность будет лучше плюс Монетный двор, на самом деле относительно легко; я использовал это под VMware Fusion 4, а не Ubuntu из-за лучшей поддержки сред, которые не могли поддерживать интерфейс Unity (Как VMware Fusion 4).