Это совершенно разные животные, которые лучше подходят для разных случаев работы с файлами или устройствами:

dd

Эта команда была создана как утилита "копирования и преобразования", первоначально предназначенная для преобразования файлов между ASCII, little-endian, байт-потоковым миром компьютеров DEC и EBCDIC, big-endian, впервые появившись на Unix Version 5. Она стала де-факто командной утилитой для работы со всем, что может быть отображено как файл в вашей Unix-подобной операционной системе (клонирование диска, резервное копирование mbr, клонирование диска как файла, копирование некоторых блоков одного файла устройства, запись образа на usb-флешку...), а при подключении к другим командам - небо безгранично. Альтернативой этой программе является команда dcfldd .

связанные с dd:

• Есть ли способ определить оптимальное значение параметра bs для команды dd?
• 11 удивительных команд DD
• 6 примеров резервного копирования Linux с помощью команды dd (в том числе с диска на диск)
• Что означает dd? - Может быть "Определение набора данных" или "Копирование и преобразование" и была переименована в dd только потому, что cc была зарезервирована для компилятора C. Выбор теории именования остается за вами ;)

cp

Сделать копию файлов и каталогов. Это более "высокий" уровень абстракции, где вы можете рекурсивно копировать каталоги, не заботясь о размере блока, преобразовании файлов и т.д. Это лучший инструмент для работы с "1 ко многим" случаями копирования файлов, права собственности, следования символической ссылке, рекурсивного копирования и многословности. Тем не менее, у него есть свои ограничения, такие как работа с изменениями файлов, удаленное копирование, и эти вещи лучше обрабатываются rsync.

связанные с cp вещи:

• Можно ли посмотреть скорость cp и процент копирования? - конкретный случай rsync - лучший инструмент для локального копирования файлов ;)
• Разница между cp -r и cp -R (команда копирования)

rsync

Может копировать файлы внутри одного компьютера, но его возможности более полезны в сценариях удаленного копирования. Некоторые из этих возможностей - обработка/манипуляция правами собственности, более простые выражения "исключить" для лучшего копирования, проверка контрольной суммы файла, чтобы узнать, был ли файл уже скопирован, удаление исходных файлов во время или после копирования, использование "прозрачной оболочки" путем вызова нужного протокола с помощью определенного URI(ssh://, rsync://...), конвейеризация и другие вещи, которые создают оптимизированную среду для удаленного зеркалирования.

rsync:

• rsync все файлы удаленной машины по SSH без пользователя root?
• Фильтр Rsync: копирование только одного шаблона
• Rsync - 10 практических примеров
• Как сделать резервную копию Linux? 15 примеров команд rsync

Дальнейшее чтение:

• dd vs cat - актуальна ли dd в наши дни?