Bash: при чтении строки «или каждые 60 секунд»

Один миллион запросов из 10 000 ключей, если требуется производительность, используйте perl:

#!/usr/bin/perl

# create hash from file2
($f2) = pop @ARGV;
%hash = map { reverse split } do { local @ARGV=($f2); <>};

# loop over file1 
while ( <> ) {
   chomp;
   @F = split;
   print "$_ $hash{$F[4]}\n";
}