Какие команды unix для мониторинга работы диска доступны?

Поскольку вы сломали дерево разрешений для каталогов с помощью chmod -R , вам необходимо исправить их все. Запустите это из каталога выше dir :

find dir -type d -exec chmod u=rwx,go=rx {} +
find dir \! -type d -exec chmod u=rw,go=r {} +

Если вам интересно, вам нужно разрешение x для доступа к каталогу. Вам нужен rx , чтобы его можно было прочитать.