Думаю, проблема в том, что вы установили ядро ElRepo. Оно не считается «нормальным» ядром, поэтому встроенные инструменты Linux не рассматривают его как ядро. Попробуйте выполнить следующую команду, чтобы узнать, сколько официальных ядер распознано.
rpm -q kernel
Если вы хотите удалить предыдущее ядро, вы должны запустить
yum remove kernel
Но будьте осторожны :) И помните, вы не можете управлять ядром elrepo с помощью стандартных системных инструментов.