Сервис против процесса?

Чтобы исправить разделители полей для последнего поля:

$ awk -F'|' '{a[$1"|"$2]=a[$1"|"$2]","$3} END{for(x in a)print x"|"substr(a[x],2)}' file.csv
A4690021|product.storeName|Cine
A4690021|product.parentCategory.id|999.54215013.999.54216013
A19129625|product.author|. VV.AA.
A4690021|product.director|Steven Spielberg
A4690021|product.actor|Laurel Cronin,Bob Hoskins,Caroline Goodall,Julia Roberts,Maggie Smith,Amber Scott,Charlie Korsmo,Robin Williams,Dustin Hoffman
A4690021|product.parentCat.displayName|Infantil
A4690021|product.bestSellers|Offline Best Seller,Online Best Seller

Проблема с оберткой строк

Преобразуем исходный файл в формат DOS/Windows:

$ unix2dos <file.csv >file.dos
$ awk -F'|' '{a[$1"|"$2]=a[$1"|"$2]","$3} END{for(x in a)print x"|"substr(a[x],2)}' file.dos
A4690021|product.storeName|Cine
A4690021|product.parentCategory.id|999.54215013.999.54216013
A19129625|product.author|. VV.AA.
A4690021|product.director|Steven Spielberg
,Dustin Hoffmanllactor|Laurel Cronin
A4690021|product.parentCat.displayName|Infantil
,Online Best SellerstSellers|Offline Best Seller

Это похоже на ваш проблемный вывод.

Решение - запустить dos2unix или другую утилиту, чтобы удалить окончания строк DOS/Windows.