FreeBSD jails - Nginx, PHP-FPM, Wordpress - Общий доступ к папке между jails (только для чтения)

Вы можете просто отбросить сообщения об ошибках:

rm * 2>/dev/null

Это отбросит все ошибки. Если вы хотите видеть другие потенциальные ошибки, то можно поступить сложнее:

rm * 2>&1 | grep -v 'cannot remove .*: Is a directory'

В этом случае другие ошибки все равно будут записаны в журнал.