Не знаю, насколько велики ваши данные, но вы можете использовать rsync
для перемещения данных из источника в место назначения. Команда ниже ничего не удалит из пункта назначения.
rsync -avz / some / directoryies / structure / / etc /
Приведенная ниже команда внесет изменения в ваш целевой каталог.
rsync -av --delete / some / directoryies / structure / / etc /
Это удалит файл из / etc /
, которого нет в / some / directoryies / структура /