Это нормально, что переменная LD_LIBRARY_PATH отсутствует в среде?

Согласно strace lsof открывает файлы устройства с правами на чтение и запись:

open("/dev/bus/usb/003/001", O_RDWR)    = -1 EACCES (Permission denied)

Вы можете использовать capability CAP_DAC_OVERRIDE, чтобы дать право root на чтение и запись любого файла в системе только утилите lsusb, запущенной определенным пользователем.

Этот ответ содержит общие инструкции по настройке возможностей. В вашем случае /etc/security/capabilities.conf должен выглядеть так:

CAP_DAC_OVERRIDE        your_username
none    *

Изменения произойдут при следующем входе в систему. Перезагрузка - самый простой вариант. Проверьте возможности пользователя:

$ capsh --print
Current: = cap_dac_override+i
...

Установка возможностей утилиты lsusb:

$ setcap CAP_DAC_OVERRIDE+ie /bin/lsusb
$ getcap /bin/lsusb
/bin/lsusb = cap_dac_override+ie