top
покажет, что использует ваш процессор. Если он у вас установлен, htop
позволяет вам более детально управлять, включая фильтрацию - в вашем случае - CPU.
Проверьте, что /etc/ssh/sshd_config
содержит:
UsePAM=yes
и что /etc/pam.d/sshd
содержит:
session required pam_limits.so
До сих пор нет ответа, почему 1048576 - это макс.
1048576, кажется, для каждого процесса. Таким образом, имея несколько процессов, этот предел можно преодолеть.