Могу ли я убедиться, что история регистрирует все исполнения?

Эта проблема обычно возникает, когда вы добавляете диск и забываете изменить имена устройств в /etc/fstab или там, где есть ссылка на корневую файловую систему.

Например, диск может изменить имя своего устройства с /dev/sda на /dev/sdb. Вот почему современные системы используют метки или UUID для правильной идентификации файловых систем, даже если они по каким-то причинам переупорядочены.