Как Systemctl приостанавливает работу?

Для правильной работы требуется поддержка в дистрибутиве (я ввел поддержку UEFI в ALT Linux); можно обойти эту проблему, используя символические ссылки и обновляя драйверы файловой системы, или, конечно же, скопируйте какой-нибудь пользовательский скрипт в /etc/grub.d ...

FWIW самая развитая инфраструктура обработки двоичных файлов PE-COFF, которую я видел до сих пор, была создана в PLD Linux.