В дополнение к ответу heemayl, вы можете перечислить нужные вам минуты, хотя это менее компактно и, вероятно, более подвержено ошибкам, чем существующий способ:
1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58 * * * * some_command
Вы можете попробовать nomodeset
в качестве параметра загрузки ядра. Это не предотвращает вывод, но не позволяет ядру переключать режимы видеокарты.