Попытайтесь отключить RAID-контроллер в Усовершенствованной конфигурации BIOS и использовать стандартный AHCI или IDE контроллер SATA. Это могло помочь - из меню начальной загрузки существует больше опции включая начальную загрузку от дисков.
Похоже на необходимость в специальном драйвере для жесткого диска.
Если я гуглю "Fujitsu, PRIMERGY TX100 S3 CentOS" первый хит является ссылкой на техническое описание на CentOS на этом сервере.