Учитывая два файла, как мне узнать общее количество изменений строк?

Я бы использовал утилиту date , чтобы получить текущее время в секундах.

#!/bin/bash
lastTime=-5

while true
do
    currentTime=$(date +%s)
    elapsedTime=$((currentTime - lastTime))
    if [[ $elapsedTime -ge 5 ]]
    then
        echo 'Something different'
        lastTime=$currentTime
        i=0
    else
        # process of random duration; not important
        r=$(( 1 + RANDOM % 3 ))
        sleep ${r}s
        i=$((i + r))
        echo $i
    fi
done

Редактировать: Изменено начальное значение lastTime , так что оно также "делает что-то другое" в начале.