Почему сценарии systemd не дают ожидаемых результатов при загрузке, но корректно после этого?

Самым простым решением является предоставление optino ntp-серверов в ваших договорах аренды dhcp:

subnet 192.168.10.0 netmask 255.255.255.0 {
    option routers 192.168.10.1;
    option ntp-servers 192.168.10.1, 192.168.10.50;
    BLAH BLAH
 }

По умолчанию пакет ntp debian поставляется с перехватчиком dhcp-exit, который добавляет ntpservers, перечисленные в аренде dhcp, в ntp.conf.