Попробуйте этот сценарий:
sort -k 3,5 -u yourFile.txt | awk '{output = $3; for(i=4; i<=NF; i++) output = output " " $(i); print output;}'
, где опция -k устанавливает колонки C и D в качестве ключевых, -u уникальные и awk печатает колонки C и D.
.