Все, что вы хотите, можно сделать с помощью chroot или, возможно, даже lxc в debian.
РЕДАКТИРОВАТЬ:
Вы можете использовать overlayfs или squashfs, чтобы сделать то, что вы делаете, быстрее (мгновенно). Для этого вам понадобятся инструменты debootstrap и squashfs.
С помощью этих инструментов вы сможете предоставить своим пользователям различные версии среды выполнения или архитектуры на выбор. Для этого вам понадобятся qemu-user-static
и ChrootDebootstrap
.