Действительно ли возможно получить рабочую историю для многострочных команд в mksh, с помощью vi режим редактирования?

Вычисление будет обработкой изображений и машинным обучением.

Если нет что-то очень необычного продолжения в одной из этих двух категорий (я не вижу признака в Вашем вопросе, что существует), они - просто операции общего назначения и не требуют ничего специального с точки зрения конфигурации системы.

Сервером будет CentOS, таким образом, я буду думать о фетровой машине.

Fedora не параллелен CentOS WRT версии по умолчанию компонентного программного обеспечения, таким образом (хотя Вы описали очень мало о том, что Вы хотите сделать) это вряд ли будет иметь любое значение. Т.е. это кажется, что Вы намереваетесь выполнить некоторые задачи общего назначения на сервере общего назначения, поэтому снова, Вам не нужен никакой специальный совет...

Я хотел бы сделать сценарий удара установки, где я устанавливаю все необходимое (vpn, zsh, cmake, Python, numpy, ffmpeg, libsvm, opencv, QT) и отправляю мне отчет через почту по окончании.

Если Вы намереваетесь копировать свою установку набор времен во многих различных системах, который имеет смысл. В противном случае Вы могли бы также просто сделать это; в зависимости от машины и скорости соединения это - очень простые 5-10 минимальных задач, большинство которых автоматизировано диспетчером пакетов. Это не требует никакого конкретного распределения или (снова) любой специальной установки.

Затем для тестирования его я не знаю.. лучше система резервного копирования? создать изображение файловой системы?

Я ничего не вижу в отделе "обработки изображений" и "машинного обучения", который потребовал бы, чтобы Вы откатывали систему как целую. Возможно, необходимо объяснить более конкретно, что Вы хотите сделать и почему Вы верите вещам как "создание изображения файловой системы", таким образом, можно "откатывать, изменить и обновить изображение", жизненно важны (или даже relavent) к выполнению в вычислительном отношении интенсивных задач.