Разделение Linux разделяет файлы на диске, но видит как один

Не решение, а обходное решение

Я также столкнулся с подобной проблемой, и я работал вокруг этого путем установки имени хоста после установки через следующие строки, добавленные в конце моего pressed.cfg:

d-i pressed/late_command string\
    in-target /bin/bash -c 'echo desired_name > /etc/hostname'

in-target необходимо так, чтобы / относится к целевой файловой системе (который в конечном счете станет Вашей корневой файловой системой), который обычно появляется как /target во время установки.