Найдите и замените различные столбцы с помощью awk
Nexpose довольно популярен, я верю. Это - больше системы обнаружения уязвимости от того, что я собрал. Мы использовали его в моей последней компании на CentOS Linux 6.3, и это смогло взять некоторую информацию об уязвимостях в нашей конфигурации DNS, среди прочего с минимальной требуемой установкой. Мы только использовали его в порядке эксперимента, но были впечатлены тем, что мы видели.
Вместо того, чтобы делать регрессное совпадение по второму столбцу, вы, вероятно, просто хотите провести сравнение строк. Для этого в приведенный вами пример нужно включить в сравнение одиночные кавычки, что превращает всё это в кошмар с оболочкой, цитирующей кошмар. Это дает следующее:
awk "\$2==\"'Zr1'\" { \$3=\"2.222.d0\" }
\$2==\"'O1'\" { \$3=\"9.99d0\" }
\$2==\"'C25'\" { \$3 =\"7.45d0\" }
\$2==\"'H1'\" { \$3 =\"3.333d0\" }
{ print }" <UiO-66Zr-EH.mof
Первым вопросом здесь является то, что ваши значения цитируются. Я предлагаю вам просто удалить кавычки командой sed, а затем, если они вам действительно нужны, поместить их обратно после обработки файла командой awk. Что-то вроде
sed "s/'//g" UiO-66Zr-EH.mof | awk '{$2=q $2 q}' q="'"
трюка выше устанавливает переменную q в ', так что q $2 q эквивалентно '$2'. Просто простой способ получить awk, чтобы поиграть с одиночными кавычками.
На основе вашего сценария, вы, кажется, хотите, чтобы он выполнял следующие замены:
$2 is $3 should be
---------------------
Zr1 2.008.d0
O25 -1.179d0
O1 -0.582d0
C25 -0.121d0
C13 -0.002d0
C1 0.625d0
O29 -0.741d0
H1 0.127d0
H25 0.495d0
Если это так, я бы сделал что-то вроде
$ sed "s/'//g" UiO-66Zr-EH.mof |
awk 'BEGIN{
c["Zr1"] = "2.008.d0";
c["O25"] = "-1.179d0";
c["O1"] = "-0.582d0";
c["C25"] = "-0.121d0";
c["C13"] = "-0.002d0";
c["C1"] = "0.625d0";
c["O29"] = "-0.741d0";
c["H1"] = "0.127d0";
c["H25"] = "0.495d0";
}
{if( $2 in c){$3=c[$2]; $2=q$2q}}1;' q="'"
Объяснение
- Изначальный
sedпросто удаляет все одиночные кавычки из входного файла. - Результат седа передается как входной в
awk - Блок
BEGIN{}выполняется до чтения файла и настраивается ассоциативный массив , содержащий ваши связки. - В основной программе я просто проверяю, определено ли
$2в массивеcи если да, то я заменяю$3на соответствующее значение из массива. - Блок
$2=q$2qпросто возвращает одиночные котировки обратно вокруг$2. - Наконец,
1;печатает строку.
Вывод при запуске на вашем примере:
unit ntype qqatom
1 'Zr1' 2.008.d0
vibration
0
improper
0
unit ntype qqatom
2 'H1' 0.127d0
vibration
0
improper
0
unit ntype qqatom
3 'C25' -0.121d0
vibration
0
improper
0
unit ntype qqatom
4 'O1' -0.582d0