Как я рекурсивно применяю ACLs по умолчанию каталога его потомкам?

Как указано ott - Ваш сценарий имеет CR LF окончания строки. Это более видимо с od.

$ od -c script
0000000   #   !   /   b   i   n   /   b   a   s   h  \r  \n   w   h   i
0000020   l   e       r   e   a   d       n   a   m   e   ;       d   o
0000040  \r  \n   e   c   h   o       "   N   a   m   e       r   e   a
0000060   d       f   r   o   m       f   i   l   e       -       $   n
0000100   a   m   e   "  \r  \n   d   o   n   e       <       /   h   o
0000120   m   e   /   M   a   t   t   /   s   e   r   v   e   r   s   .
0000140   t   x   t  \r  \n
0000145

Как Вы видите, Вы имеете \r (возврат каретки) и \n символы (перевода строки) в конце каждой строки, где Вы должны только иметь \n персонажи. Это - результат проблемы совместимости между Windows, и *отклоняют системы. Bash испытывает затруднения при контакте с \r персонажи.

Можно исправить сценарий при помощи утилиты как dos2unix или путем выполнения следующей строки.

sed -i 's/\r$//' script