Выполните Java classfile от терминала
Можно попробовать, Запускают, или можно хотеть настроить установку/сервер начальной загрузки PXE для нескольких дистрибутивов. Или если некоторые Ваши машины являются бездисковыми, можно попробовать метод LTPS (это - то, что обычно называют - тонкий клиент - IIRC), также посмотрите здесь
Править: Если это так, посмотрите это
Если Вы работаете java folder/somefile Java пытается найти класс somefile в пакете folder, но Ваш класс не расположен в пакете folder, это просто расположено в пути folder. Можно скорректировать путь поиска для классов с помощью -cp опция (значение пути к классу).
Например, наличие класса YourClass в пакете your.package, этот пакет расположен в /your/path можно выполнить его от любого местоположения с:
java -cp /your/path your.package.YourClass
В Вашем конкретном случае необходимо работать:
java -cp folder somefile
Я надеюсь, что это достаточно ясно ;-)