Что файлы расположены в '/var/crash / '?

Если необходимо сохранить команду в переменной, не используйте строку, которая просто не может работать. Посмотрите Bash FAQ № 50. Используйте функцию или массив.

Ваша строка анализируется как присвоение var="bash createGnuploat.sh "${exp[j]}" ../Result/ 0" сопровождаемый этими двумя словами ${arr[i]} (который будет взят в качестве названия команды), и ${exp[j]} (который будет первым и единственным аргументом команде). Проверьте подсветку синтаксиса в свой вопрос или в Вашего редактора, это показывает то, что в заключенной в кавычки строке.

Всегда используйте двойные кавычки вокруг подстановок переменных, например. "$foo". Иначе значение переменной разделяется на слова, которые интерпретируются как шаблоны шарика. (Опустите двойные кавычки в 0,01% случаев, где это - желаемое поведение.) Для массива, использовать "${foo[@]}" иметь каждый элемент массива в отдельном слове ("${foo[*]}" отдельное слово с элементами массива, разделенного пробелами; если Вы не учитываете кавычки, то каждый элемент повреждается в отдельные слова, которые интерпретируются как шаблоны шарика).

Вот Ваш отрывок, переписанный с помощью функции:

create_plot () {
  bash createGnuploat.sh "${exp[$2]}" ../Result/ 0 "${arr[$1]}" "${exp[$2]}"
}

for j in "${!exp[@]}"
do
    arr=([1]=mem [2]=gen [3]=usr)
    for i in "${!arr[@]}"
    do
      create_plot "$i" "$j"
    done
done

Для редких случаев, где имеет смысл использовать переменную типа массив вместо функции:

for j in "${!exp[@]}"
do
    arr=([1]=mem [2]=gen [3]=usr)
    for i in "${!arr[@]}"
    do
      var=(bash createGnuploat.sh "${exp[j]}" ../Result/ 0 "${arr[i]}" "${exp[j]}")
      "${var[@]}"
    done
done