Стандарт иерархии файловой системы: http://refspecs.linuxfoundation.org/fhs.shtml
Стандарты кодирования GNU: http://www.gnu.org/prep/standards/ также имеет политики в отношении использования каталога и иногда не соглашается с FHS
"Папка" является термином, использованным Mac и людьми Windows для обращения к каталогам. Используя его в Unix земля заставляет Вас походить на новичка, который еще не стал ориентированным.
Это - проблема с выходным модулем vlc, необходимо выбрать тот, который работает с X-сервером / настольная среда. Откройте предпочтения vlc, изменение рекламы Ваш выходной модуль:
Определенный, который необходимо использовать, будет зависеть от системы, попробовать X11 video output
и, если это не работает, попробуйте другие, пока Вы не находите тот, который делает.