Есть ли способ взаимодействовать с оболочкой, но из приложения или отдельной программы?

expect— инструмент. Читатьman expecthttps://linux.die.net/man/1/expect

Управляющему приложению необходимо открыть два канала, дважды используя канал (). Затем он разветвляет дочерний процесс.

Оставаясь в исходном коде, родитель закрывает конец записи одного канала и конец чтения другого.

Тем временем дочерний процесс закрывает противоположные концы этих каналов и использует dup2 ()для переназначения их потокам 0 и 1. Таким образом, у родителя остается канал, который записывает в стандартный ввод дочернего элемента, и канал, который читает из stdout ребенка.

Наконец, дочерний exec является требуемой оболочкой с требуемыми аргументами.