Получен EOS из элемента "pipeline0" на gst fbdevsink

Поскольку вы знаете номер строки переменной, в которой она находится в файле script.bash, вы можете сделать это:

#!/bin/bash
file="$HOME/script.bash"
mynewvariable='one
two
three'

substitute_everything_inside_variable () {
    tmpf=$(mktemp)
    printf '%s\n' "$1" |
    sed -e "s/'/'\\\''/g" -e 1s/^/variable=\'/ -e \$s/\$/\'/ > "$tmpf"
    sed -i -e "4r $tmpf"  -e '5s/^/#/' "$2"
    rm -f "$tmpf"
}

substitute_everything_inside_variable "$mynewvar" "$file"
#### eof #####

Таким образом, вы избегаете капризов кавычек и неизвестного диапазона строк переменной $.

ХТХ