Найти файл по шаблону, но игнорировать файлы с похожими шаблонами

Насколько я понял, у вас есть несколько файлов, и их имена хранятся в файле с именем fileA, а затем вы хотите распечатать все из каждого файла, кроме текста, хранящегося в fileB, поэтому вы можете сделать:

while read -r file_name
do
grep -v -f <(grep -A1 -f fileB "$file_name") "$file_name"
done < file

Содержимое будет распечатано на stdout.