Что происходит после того, как я ввел пароль для входа в систему и до того, как появится приглашение оболочки? и как уменьшить время для этого интервала?

Если вы хотите попробовать альтернативный, очень чистый и простой инструмент (https://github.com/johnkerl/miller), начните с папки, в которой у вас есть входные CSV-файлы, с помощью этой команды

mlr --csv unsparsify *.csv >out.csv

у вас будет

A,B,C,D,F,E
10,20,10,20,5,
,20,10,20,10,5
,,,10,20,30

Если вы хотите, чтобы F был в конце, команда

mlr --csv unsparsify then reorder -e -f F *.csv

Если у вас много файлов, вы можете сделать это в два этапа:

mlr --icsv cat *.csv >tmp.txt
mlr --ocsv unsparsify tmp.txt >out.csv