По определению пользователь root должен иметь полные права абсолютно на все, в системе, :если что-то пойдет не так, root должен быть надежным.
Вы можете создать группу администраторов, которую вы назначите своим системным администраторам. Затем вы можете использовать разрешения Linux для уточнения прав доступа к вашим папкам.