Вот иллюстрация метода транспонирования -линейного фильтра -транспонирования . Возможно, это не подходит для вашего (большого файла ), но может быть полезным для других:
$ cat file
F G F H H
G F F F A
F G F F F
F F F T F
, затем
$ rs -T < file | perl -alne 'print unless (grep { $_ eq "F" } @F) > 3' | rs -T
F G H H
G F F A
F G F F
F F T F