Использование `$@.o `в зависимости Makefile не будет работать

Я сосредоточился на названии

Find any line in VI that has something other than ATCG

И я протестировал это в редакторе VI, так называемый "режим последней строки".

:%!tr -c -d 'ATCG\n

:переходит в режим строки команды -, %сопоставляет весь файл как диапазон, !фильтрует этот диапазон с помощью внешней команды tr -c -d 'ATCG\n, которая оказывается такой же, как написал @Kusalananda :).